إن من أهم الأهداف وراء إنشاء الهيئة السعودية للتخصصات الصحية عام 1413هـ هو تقديم برامج دراسات عليا لغرض التأهيل العالي في المجالات الصحية المختلفة والإشراف على تلك البرامج وتوفير فرص تدريب مهني مقنن لخريجي الكليات الطبية والصحية داخل المملكة وخارجها وقد اعتمدت الهيئة لوائح خاصة لغرض التدريب والامتحانات في برامجها كما عملت الهيئة على أن يكون لديها لائحة معتمدة للإعتراف بالمراكز التدريبية لغرض إنتقاء المستشفيات الحكومية والخاصة المجهزة بالكوادر البشرية والمادية القادرة على توفير تدريب بمستوى جيد وقد بلغ عدد المراكز التي تم الاعتراف بها 74 مركزاً تدريبياً داخل وخارج المملكة ، وقد تمكنت الهيئة منذ إنشائها من تقديم 59 برنامجاً في التخصصات الرئيسية والفرعية والدقيقة في مجالات صحية مختلفة وبلغ عدد المتدربين المسجلين في برامج الهيئة قرابة 3700 متدرب حتى هذا العام ، ولقد فاق عدد أعضاء لجانها ومجالسها العلمية/ 500 عضو يشرفون على كافة البرامج ، والهيئة إضافتاً إلى أنها تقدم برامج خاصة بها هي أيضاً تقوم بدراسة واعتماد برامج تدريبية أخرى تقدمها جهات حكومية وخاصة صحية ، والهيئة بدورها تشرف على بعض تلك البرامج من خلال إبرام إتفاقيات مشتركة بين الهيئة والجهة المقدمة للبرنامج.